[GUIDA] Rosetta@Home

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Boinc

qui potrete sempre controllare l'ultima versione disponibile del client BOINC

PCTuner Research Team Italy

Intro...

Troppo tempo è passato da quando l'ultima WU di FaD e stata elaborata...
bisognava riportare in alto il nome del forum... e speriamo di riuscirci

Come da tradizione, e anche per fare un po' di bene, è stato scelto un progetto NON a fini di lucro e molto importante in ambito medico...

Il progetto Rosetta@Home ha come obiettivo il calcolo della struttura tridimensionale delle proteine...
il che è molto importante, perchè le proteine costituiscono tutto ciò che ci circonda... e anche noi stessi...

Regolano la nostra vita, il funzionamento del nostro corpo; conoscere la loro struttura diventa quindi di fondamentale importanza per la prevenzione delle malattie.

Attualmente, le proteine elaborate in Rosetta@Home servono a combattere malattie come HIV, Malaria, Cancro e Morbo di Alzheimer.

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Installazione...

L'installazione di Boinc è semplice, molto semplice, ma bisogna fare attenzione a questo passaggio...

- Single User Installation: Boinc viene installato (ed elabora!!!) solo quando è loggato l'utente attuale, che è l'unico a poterlo gestire.
- Shared Installation: Tutti gli utenti possono utilizzare Boinc.
- Service: Boinc elabora anche se nessun utente è loggato nel pc, ma solo voi potete modificarne le opzioni.

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Impostazioni...
Come si può notare, il client di Boinc installato sul Pc permette di selezionare poche opzioni; Praticamente dovremo solo impostare le modalità di accesso alla rete (Dial Up, HTTP Proxy o Sock Proxy)

Questo perchè gran parte delle impostazioni risiedono sui server del progetto, e a ogni esecuzione di Boinc vengono scaricate sul computer in uso.

Ogni progetto richiede un proprio account di accesso; tuttavia, le impostazioni generali dell'account saranno uguali per tutti i progetti.

Per accedere al proprio profilo e alle proprie impostazioni e sufficiente raggiungere la pagina del progetto (in questo caso Rosetta@Home, inserire i propri dati e loggarsi.

Nella prima parte, Account Information è possibile impostare i dati generali del proprio account, quindi e-mail, pagina web, nazione e gestire le credenziali di accesso all'account.

Se poi voleste interagire con la vita del forum di Rosetta@Home, non dimenticate di creare e compilare il vostro profilo.... creandolo potreste essere selezionati come User of the Day e apparire nella home del progetto!

Una volta che avete creato il vostro account, e iniziato a elaborare... dovete solo unirvi al PCTuner Research Team Italy!
Farlo è molto semplice:
- Accedere alla Home Page del team
- Cliccare su "Join"
- Cliccare su "Join Team"

Veniamo ora all'impostazione delle opzioni vere e proprie:

Da General Preferences diremo come viene usato il nostro sistema: diciamo che per un uso normale possiamo lasciare inalterate le impostazioni di default... ma per ottenere il meglio...

Do work while computer is in use? - Impostare su Yes per fare in modo che l'elaborazione continui anche mentre usiamo il pc.

On multiprocessors, use at most - Impostazione molto importante sui moderni dual e quad core, vi permette di impostare il numero massimo di core (o di processori, nel caso in cui siete felici possessori di un sistema multiCPU) da utilizzare per l'elaborazione.
Quindi, nel caso possediate una CPU Single Core qualsiasi valore va bene, tanto ne verrà usato sempre e solo uno.
Nel caso di una CPU Dual Core o Single Core con HT potrete scegliere se usare entrambi i core (impostando a 2 questo parametro) per elaborare i dati oppure uno solo( = 1).

Connect to network about every - Modificando questo parametro è possibile indicare a Boinc la cache da scaricare: ecco come funziona.
Boinc scarica una certa quantità di dati, che possono bastare per il tempo da voi indicato, in base alla potenza del pc su cui è installato (potenza stimata in base a un benchmark eseguito durante l'installazione).
Benchè il massimo sia 10 giorni, è sconsigliabile impostare un valore così alto, in quanto i dati da elaborare hanno una sorta di "data di scadenza".
Impostare un paio di giorni è sempre la soluzione migliore

Come si può notare dal fondo di questa pagina, è possibile creare più profili per poi utilizzarli in diversi ambiti... per esempio, "Scuola", "Casa" e "Lavoro".

Nella pagina Rosetta@home preferences è possibile indicare la percentuale di risorse del sistema da dedicare a Rosetta... se seguite solo questo progetto, lasciate pure 100.

message board preferences contiene le impostazioni riguardanti il forum di Rosetta: è possibile selezionare il vostro avatar, la vostra firma e tutte le impostazioni "Forum Style".

La parte seguente contiene le vostre statistiche, tra cui ricordiamo i vostri Credit, Pending Credit e l'elenco dei pc che elaborano per voi.

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Credits...

Ad ogni WU elaborata, Boinc assegna un certo punteggio, calcolato secondo alcuni parametri come il tempo necessario al calcolo della WU e la potenza del PC.

Tuttavia, quando una WU viene conclusa, i Credits non vengono subito assegnati all'utente, ma diventano temporaneamente dei Pending Credit.

I Pending Credits diventano dei Credits quando un certo numero di utenti (variabile da progetto a progetto) rispedisce indietro i risultati dell'elaborazione;

Una volta che il quorum (ossia numero di elaborazioni necessarie) è stato raggiunto, il server assegna i Credits in modo "permanente"... facile no!



Questa immagine riassume al meglio il metodo di assegnamento dei Credits.

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Boinc on USB!

Ovvero.... come scaccolare ovunque!

Esistono principalmente due metodi...

1 - Installare una copia di Boinc sulla pennina e copiarla sul pc da parassitare

2 - Installare Boinc sul Pc ospite e copiare solo le WU (utile per pc non connessi a Internet)

Partiamo col primo...
Scaricare questo file e scompattarlo in una cartella a scelta del vostro pc...

Aprire il Boinc Manager (boincmgr.exe) situato nella pennina, e ripetere le stesse cose che si sono fatte con Boinc "Fisso", quindi collegarsi al progetto, inserire user e psw, ecc

Ora, dopo aver copiato tutta la cartella sulla pennina USB, siamo pronti a sfruttare la potenza di tutti i pc con cui abbiamo a che fare!

unico accorgimento.... Boinc accede molto spesso in scrittura alla memoria, e considerato che nel caso di una pennina la memoria è statica, questo non gli fa molto bene....
Vi consiglio di copiare Boinc sul pc ospite prima di iniziare a scaccolare e di ricopiarvi tutto sulla pennina al termine

Metodo 2 - Work in progress

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Nascondere i propri PC...

Ovvero... come scaccolare al lavoro senza rischio di ban professionale ...

1) Collegatevi all'indirizzo hhhttp://boinc.bakerlab.org/rosetta/
(se non siete loggati fatelo)
2) cliccate su Your account - view stats, modify preferences nell'area "Returning participants"


3) siete nell'area "Your account", andate alla sezione "Preferences" e cliccate su View or edit di "Rosetta@home preferences"


4) siete nell'area "Rosetta@home preferences", c'è la voce "Should Rosetta@home show your computers on its web site?" di default impostata su yes (il che significa che acconsentite a far vedere le vostre macchine), quindi cliccate su Edit Rosetta@home preferences


5) modificate la voce e salvate cliccando Update preferences


6) affinchè le modifiche abbiano effetto occorre "soncronizzare" il client, quindi aprite il client e andate nella sezione "Project" e cliccate su Update




Note:
a) potrebbe comunque volerci del tempo affinchè visivamente le opzioni vi vengano mostrate modificate
b) voi continuerete a poter vedere i vostri computer (per una verifica chiedete ad un amico)
c) abilitando i diversi profili è possibile impostare una visibilità differente per più PC, supponendo che il profilo di "default" abbia la visibilità attiva e quello "work" disattivata è sufficente impostare per il PC che si vuole nascondere il profilo "work"
Attenzione! Anche le "General preferences" hanno i medesimi nomi di profili quindi fate attenzione a coordinare i due tipi di informazioni: potete applicare ad un PC un solo nome di profilo, quindi se apllicate "work" ad un pc avrà sia le impostazioni di "General preferences" che di "Rosetta@home preferences" specificate nei rispettivi "work"


Thx to: Reziel

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I Profili...


Esistono quattro profili:
- default: preimpostato e predefinito per ogni PC che viene inserito dall'utente, ma comunque modificabile
- home
- school
- work

Selezionare un profilo attiva per il PC tutte le configurazioni specifiche impostate in "General preferences" e "Rosetta@home preferences" (se in una delle due sezioni non è specificato nulla per il profilo scelto verranno usati i valori di default), quindi fate attenzione a coordinarle

A cosa servono:
- sono comodi per chi ha un solo PC, ma deve cambiare periodicamente le impostazioni: invece di accedere manualmente ad ogni voce si può così avere fino a quattro profili già pronti
- sono ancor di più utili a chi ha più di un PC e vuole impostare, tipicamente, tempi di connessione diversi in base all'uso del pc

Vedremo adesso:
- come attivare un profilo in "General preferences" (in modo analogo si possono attivare in "Rosetta@home preferences")
- come selezionare il tipo di profilo per un PC


Come sempre si parte dalla homepage e si va nella pagina personale dell'utente "Your Account" (se non siete loggati dovete farlo)


Siete nella pagina "Your account", nella sezione "Preferences" cliccate su View or edit di "General preferences"


Siete adesso nella pagina "General preferences", in fondo ci sono tre link per attivare i rispettivi profili
Cliccate sul profilo che intendete attivare e configurare (per esempio su Add separate preferences for work)


Impostate i valori e salvate cliccando su Add preferences


A questo punto nella pagina "General preferences", avrete la possibilità di vedere i profili attivati, in elenco o in modalità affiancata


Per impostare la modalità affiancata cliccate su Switch View, per tornare alla modalità lista cliccate di nuovo su Switch View
Nota: nell'immagine seguente si può inoltre vedere come la modalità affiancata consenta un confronto immediato dei parametri, la possibilità di aggiungere, modificare o rimuovere i profili con gli appositi link posti in fondo


Nota: i passi che seguono sono quelli da fare ogni volta si voglia cambiare l'associazione tra PC e profilo

Una volta attivati i profili, tornate alla pagina "Your Account" e nella sezione "Work Done" cliccate su View di "Computers on this account"


Avrete così l'elenco dei vostri PC, selezionate quello a cui volete assegnare un profilo specifico cliccando sul numero corrispondente alla voce "Computer ID"


Avrete l'elenco delle caratteristiche del PC selezionato ed in fondo alla pagina potrete scegliere il profilo da associare al PC tramite un menu a tendina, sempre da questo menu sarà possibile cambiare di nuovo profilo
Nota: impostare la voce "---" equivale ad assegnare il profilo predefinito


Thx To: Reziel

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I Profili... vol. 2

Note:
a) poiché queste preferenze riguardano il client e non il progetto esse, di fatto, gestiscono il PC selezionato indipendentemente dal progetto in esecuzione, quindi una modifica a queste impostazioni modifica il comportamento del PC non solo con Rosetta@home ma anche con gli altri progetti
b) poiché queste modifiche possono essere fatte dal sito di ogni progetto, solo l'ultima modifica fatta viene presa in considerazione
c) affinchè le modifiche abbiano effetto occorre "sincronizzare" il client:
in automatico alla prossima connessione con il server
- manualmente aprendo il client e cliccando su Update nella sezione "Project"



Verificare che il client segua le impostazioni del profilo

Dal client (vista avanzata) installato sul PC che avete associato al profilo, verificate da "Activity" che siano impostati i seguenti valori:
- "Run based on preferences"
- "Network activity based on preferences"